Szkoła została założona w 1947 roku na mocy decyzji Kuratorium Okręgu Szkolnego Białostockiego z dnia 18 marca 1946 r. jako Publiczna Średnia Szkoła Zawodowa.

Z dniem 1 września 1973 r. powołano Zespół Szkół Zawodowych Nr 2, w skład którego wchodziły następujące szkoły: 
- Zasadnicza szkoła Zawodowa im. gen. Ignacego Prądzyńskiego, 
- Liceum Zawodowe Mechaniczne, 
- Zasadnicza Szkoła Zawodowa Dokształcająca, 
- Ośrodek Dokształcania Zawodowego.

Po kolejnych kilku przekształceniach w dniu 5 czerwca 2002 r. na podstawie Uchwały Nr N294/XXXIX/2002 Rady Powiatu w Augustowie powstał Zespół Szkół Technicznych im. gen. Ignacego Prądzyńskiego, w skład którego wchodziły szkoły ponadgimnazjalne (Technikum Nr 2, II Liceum Profilowane i Zasadnicza Szkoła Zawodowa Nr 2) i onadpodstawowe (9 typów szkół). 
Zespół Szkół Technicznych im. gen. Ignqacego Prądzyńskiego tworzy, prowadzi, przekształca i likwiduje Rada Powiatu Augustowskiego.

W skład Zespołu wchodzą:

- Technikum Nr 2 w Augustowie,
- Branżowa Szkoła I Stopnia Nr 2 w Augustowie,
- Szkoła Policealna Nr 2 w Augustowie,
- Szkoła Policealna dla Dorosłych Nr 2 w Augustowie.